En esta investigación se realizó la identificación de las principales variables que afectan de forma negativa el sistema de gestión de calidad (SGC) de la IPSI indígena TOTOGUAMPA, lo que permitió generar una propuesta con el fin de mejorar la eficiencia del mismo, esperando mejoren la prestación de los servicios de salud en la IPSI, para esto se aplicaron una metodología mixta, mediante diferentes instrumentos de investigación y revisión documental, como matrices de conceptos claves y entrevista estructuradas, siempre contando con el apoyo de la IPSI.